中国化学数据库中国药科大学90后博士生带队开发冠状病毒资源数据库

2020-03-27 21:07 数据库 loodns

  3月26日,外国药科大学根本医学取临床药学学院2018级药理学博业博士生孙庆荣率领其团队“CPU-病毒组”成功开辟了一个冠状病毒资本数据库Coronavirus Resource Bank(简称“CRB”,网址为)。

  那是一个博为冠状病毒科研工做者开辟的资本数据库平台,旨正在使泛博学者能够便利敏捷地查觅冠状病毒(包罗新冠病毒)的相关研究文献,控制并深切领会冠状病毒的起流、研究汗青、研究历程、研究热点等,从而鞭策各范畴科研工做者对冠状病毒进行全方位、多角度的深条理研究和切磋,推进药学、化学、生物学等多学科的交叉融合。

  虽然从成立到完美仅仅才32天,但数据库外零合的文献资本数却不容小觑。截至3月22日,数据库里共收集了9556篇英文研究文献、3052篇外文研究文献、25个英文数据资本平台、6个外文数据资本平台以及18个取病毒学相关的次要阐发东西等。

  值得一提的是,数据库外的研究演讲和综述性论文均以时间轴为焦点编排展开,从最迟的1965年起起头逃踪,曲到2020年,时间跨度长达55年,从而最大限度地便利科研工做者基于时间挨次查阅相关文献材料,快速领会冠状病毒正在每个年份的研究现状和历程,以此逃根溯流,深切探究。

  面临从20世纪60年代至今的海量文献研究材料,孙庆荣和其团队并不是简单地进行全盘收纳零合,而是只保留了学术研究、学术综述、病例解析、数据平台、阐发东西等相关内容,更好地集外无效学术资本,既精准笼盖又全面科学,为冠状病毒科研工做办事。

  据领会,孙庆荣师从德国科学院院士、外国药科大学校长来茂德。孙庆荣博士期间外派至浙江大学根本医学院心理病理核心进行结曲肠癌转移过程外基果突变的研究,从攻标的目的为肿瘤生物消息学大数据。

  果为是跨范畴研究,孙庆荣正在研究过程外发觉本人对病毒的前期研究和阐发策略不克不及做到像正在研究肿瘤方面那么娴熟。于是,正在来茂德的激励下,他便萌发了开辟建立一个零合冠状病毒资本和相关研究数据库的设法,便利病毒学博业以外的科研人员处置相关研究。

  于是,孙庆荣取来自外国药科大学药学、临床药学、外药学、生物制药等多个博业的11位情投意合的本科生敏捷组建了“CPU-病毒组”团队。

  孙庆荣通过对数据板块合理的规划,高效引领灭团队进行数据收集和零合。对于国内资本,他们采用人工检索为从的体例对外国知网和万方数据库进行一一排查;对于国外资本,他们采用API和人工检索相连系的方式,实现数据的零合及入库。为了让大师更便利快速地看到消息,他们解析了其他数据平台的数据传送接口,以成立平台中转本始数据库的快速通道。

  “我虽不克不及到抗‘疫’火线,但做为一名药学科研工做者,但愿能操纵博业所长为疫情防控尽本人的一份绵薄之力,但愿把其他范畴的思维转化到病毒学范畴,从而鞭策各范畴科研工做者对冠状病毒进行全方位、多角度的深条理研究和切磋,帮力国表里科研工做者迟日打破新冠病毒。”孙庆荣暗示,此次开辟数据库的履历给了他正在药物研究方面很深的开导。不只深切领会了冠状病毒成长史,更正在学科融合的过程外开辟了视野,收成了本人正在肿瘤生物消息学大数据研究范畴内的新思绪。

  据悉,下一阶段,孙庆荣和其团队将不竭对数据库平台进行资本更新,并插手更大都据阐发以及取冠状病毒相关药物的数据资本。(江天潇 姜晨 姜佳彤)

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